根据《中华人民共和国社会保险法》的规定，用人单位应当自用工之日起三十日内为其职工向社会保险经办机构申请办理社会保险登记。未办理社会保险登记的，由社会保险经办机构核定其应当缴纳的社会保险费。 因此，如果用人单位在两年后才为员工办理了社会保险登记，并且未及时缴纳相应的社会保险费用，可能违反了相关法律规定。具体情况需要具体分析，建议您向当地劳动保障部门或人力资源和社会保障局进行咨询和核实。同时，如果存在欠缴情况，您可以考虑通过协商解决或者寻求法律援助来维护自己的合法权益。