是的，您可以申请劳动仲裁。根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》，劳动者与用人单位之间因确认劳动关系发生的争议属于劳动争议的范畴。如果您认为自己被公司非法解雇或者存在其他违反劳动法律法规的情况，可以通过合法途径寻求解决。 关于佣金未结算的问题，您可以要求公司按照法律规定支付相应的赔偿金。至于不平等协议的问题，如果该协议损害您的合法权益，您也可以通过法律手段维护自己的权益。在离职后三个月内仍未收到代理费，这可能意味着公司的行为已经构成了违约，您可以据此向法院提起诉讼，要求公司承担相应的法律责任。 请记得保留好相关证据，如工资条、合同复印件等，以便于在申请劳动仲裁或起诉时提供支持。同时，建议您咨询专业的法律人士，以获得更具体的法律意见和指导。