根据您提供的信息，如果您的合同中明确约定支付工资的前提是整个工程的总体结算已完成，那么按照法律规定，公司的做法可能并不违法。然而，建议您与公司进行沟通，了解具体的施工进度和结算情况，并要求公司提供相关证明材料以支持其主张的工期延误。此外，您可以考虑通过法律途径解决争议，寻求专业的法律帮助来维护自己的权益。