根据《劳动民法典》规定，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。如果员工在法定假期前已经提出离职申请，并且与公司协商一致解除劳动合同，则不需要支付任何经济补偿金。 关于扣除工资的问题，这需要看具体的合同条款以及公司的规章制度是否合理。如果公司有明确的规定或者合理的解释，那么可能需要支付相应的赔偿金。但是，如果公司的做法不合理或违法，比如没有提供充足的证据证明其行为合法，那么员工可以要求公司退还所扣款项并承担一定的赔偿责任。 建议您尽快与公司沟通，了解具体的情况并寻求专业的法律意见。同时，如果您对处理结果不满意，也可以考虑通过法律途径解决。