在处理劳动争议案件时，首先需要明确的是，在劳动仲裁中，如果劳动者主张双倍工资，而劳动仲裁机构只裁决支付三个月的经济补偿金，则可能意味着劳动者没有达到法定要求。根据《中华人民共和国劳动民法典》第八十二条的规定，用人单位自用工之日起超过一个月不满一年未与劳动者订立书面劳动合同的，应当向劳动者每月支付二倍的工资。 因此，如果你认为自己符合上述规定，且劳动仲裁机构只裁决支付三个月的经济补偿金，那么你有权向上级劳动仲裁委员会申请复议或者直接向人民法院提起诉讼。在诉讼过程中，你可以请求法院对劳动仲裁机构的裁决进行审查，并请求法院增加双倍工资的赔偿金额。 请注意，以上建议仅供参考，具体情况还需根据具体案情来确定。同时，请务必在进行任何法律行为之前，咨询专业的法律顾问以获取最准确的法律意见和指导。