《中华人民共和国劳动法》规定，劳动者享有休息休假的权利。新华书店实行每天半天班制，六个小时的工作时间是不符合法律规定和相关劳动保护规定的。如果该书店违反了相关规定，可能会受到相关部门的行政处罚，甚至可能触犯刑法中的非法拘禁罪等刑事犯罪行为。因此，建议新华书店按照法律法规的要求进行调整，并确保员工的合法权益得到保障。