您好！关于您提到的私立学校和三方协议的问题，一般来说，如果三方协议没有被合法地签订或执行，则该协议可能不会产生法律效力。在您的情况下，由于三方协议上明确包含有5000元的违约金条款，这可能是出于对违反协议行为的一种惩罚性规定。 如果您认为该违约金条款不合理或者不合法，请考虑与学校协商解决。通常，在教育领域中，学校会根据学生的具体违规情况来决定是否收取违约金，并且违约金的比例也会因不同情况进行调整。您可以向学校的法律顾问寻求帮助，以确保您的权益得到保障。 另外，如果学校确实已经履行了协议中的所有义务，那么即使第三方未签字，也应当视为合同有效。因此，建议您与学校沟通，了解具体情况并争取双方达成一致的解决方案。 最后，对于任何涉及法律问题的情况，强烈建议您寻求专业的法律意见，以便更好地保护自己的合法权益。希望以上信息能够对您有所帮助。