在公司内部食堂吃饭属于个人行为，并不构成劳动关系。因此，如果员工在公司内部食堂就餐而被扣发工资两百元，这可能被认为是违法的。 根据《中华人民共和国劳动民法典》第十九条的规定，“劳动者在试用期期间被证明不符合录用条件的，用人单位可以解除劳动合同。”但是，在这个案例中，员工并没有违反录用条件，所以这种做法是不合理的。 此外，根据《中华人民共和国劳动法》第八十二条的规定，“用人单位自用工之日起超过一个月不满一年未与劳动者订立书面劳动合同的，应当向劳动者每月支付二倍的工资。” 综上所述，除非有明确的法律规定或合同条款表明员工的行为违反了公司的规定，否则公司不得无故扣发员工的工资。如果您对此有任何疑问，请咨询专业的法律顾问。