在处理劳动关系中，公司有权要求员工遵守公司的规定和制度。如果公司认为您违反了仓库管理的规定，并且存在缺少货物的情况，您可以与公司进行沟通，了解具体的要求和处罚措施的合理性。如果双方无法达成一致，可以考虑通过调解或仲裁程序来解决争议。 关于扣款的问题，通常情况下，除非有明确的法律规定或者合同约定，否则公司不得无故扣押员工的工资或其他福利待遇。如果公司确实需要对您的行为进行罚款，应当提供合理的证据和说明，并按照相关法律法规进行操作，以确保其合法性。同时，如果您有任何疑问或担忧，建议及时向人力资源部门寻求帮助或咨询专业的法律顾问，以便更好地维护自己的权益。