在大多数情况下，员工因迟到而被扣除的金额应根据公司的具体政策和规章制度来确定。如果公司的规定是基于迟到时间长短来进行罚款的，那么这种做法可能并不违法。 然而，如果公司有明确的规定或合同条款表明员工迟到必须承担一定的责任，并且这些规定没有得到有效的执行，或者员工认为其行为不符合公司规定，这种情况可能会被视为违法行为。在这种情况下，员工可以考虑向劳动监察部门举报，以保护自己的权益。 需要注意的是，在任何情况下，员工都应该尊重并遵守公司的规定，同时也要注意维护自身的合法权益。如果对公司的处理方式感到不满，可以与公司进行协商解决，或者选择通过法律途径寻求帮助。