在处理离职纠纷时，首先需要明确的是，如果公司不承认员工的辞职申请，那么员工可以通过以下几种途径来维护自己的合法权益。 协商解决。双方可以进行沟通和协商，以达成一致。这通常是最直接和简便的方法。 书面通知。员工可以在离开前向公司发出正式的通知，说明离职意愿并附上离职申请文件。这样有助于证明员工的真实意图，并为后续可能发生的争议提供证据。 法律诉讼。如果双方无法通过协商解决问题，或者公司的行为严重侵犯了员工的权益，可以选择通过法律途径解决。在这种情况下，建议寻求专业的法律顾问的帮助，以便更好地了解相关法律法规和具体的法律程序。 仲裁或调解。一些地区可能会有劳动仲裁机构，这些机构会根据相关法律规定对离职事件进行裁决。此外，也可以考虑与工会或其他组织合作，寻求第三方介入帮助解决争议。 在任何情况下，都应确保收集和保留所有相关的书面记录和证据，包括但不限于邮件往来、会议纪要、请假单等，以便于日后的申诉或诉讼。同时，保持冷静和理性，避免情绪化的言行，以免给后续的法律行动带来不利影响。