根据法律规定，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者支付劳动报酬。对于您的情况，如果双方没有明确约定试用期工资的具体数额，则应视为基本工资。因此，您的第一份工资应该是3500元，而之后的两个月工资应该为4000元。 关于您提到的假期扣款问题，根据《中华人民共和国劳动法》的规定，职工因病或非因工负伤停止工作医疗时，停工医疗期间不扣除工资。但是，在您的情况下，如果您的请假行为确实导致了公司损失，比如加班或者需要其他员工代班等，那么这部分损失可能需要由您承担。 建议您与老板沟通清楚相关事宜，并保留好所有的书面证据，以备日后维权之需。如果您对处理结果不满意，也可以通过劳动监察部门进行投诉，寻求进一步的帮助。