首先，根据《劳动法》的相关规定，劳动者在孕期、产期、哺乳期内应当享受相应的保护。如果员工因怀孕原因暂时无法正常工作，用人单位应当给予合理的安排和补偿。 其次，关于扣发工资的问题，具体情况需要根据双方签订的劳动合同或相关协议来判断。通常情况下，如果员工确实因为怀孕等原因暂时无法正常工作，且符合国家规定的休假条件，用人单位应按照相关规定支付相应期间的工资，并无权扣除任何款项。但是，如果员工违反了公司的规章制度或者有其他不当行为导致被解除劳动合同，那么用人单位有权根据实际情况进行处理，包括但不限于扣发部分工资。 综上所述，建议您与用人单位协商解决此事，了解具体的扣款情况并保留证据，必要时可以寻求法律帮助维护自己的合法权益。同时，也提醒用人单位注意遵守法律规定，合理安排员工的工作和休息时间，保障员工权益。