首先，您需要了解《中华人民共和国劳动法》关于工伤待遇的规定。根据该法第44条的规定，工伤职工在停工留薪期内享受原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。停工留薪期一般不超过12个月。 其次，根据您的描述，您已经向公司申请过工伤认定，并且已经进行了核磁共振检查，确定为肩袖损伤。这表明您确实遭受了工伤事故。因此，按照法律规定，您可以获得相应的工伤待遇。 如果您决定辞职，通常情况下，您有权要求公司支付解除劳动合同的经济补偿金。具体的金额取决于您在公司的工作年限和合同约定的赔偿标准。请注意，具体数额可能因地区差异和个人情况而有所不同。 为了保护自己的权益，建议您与公司进行沟通，明确告知对方您的意愿和需求。同时，收集好相关的医疗证明和工作经历等证据，以备不时之需。最后，如果有必要，您可以寻求第三方的帮助，如工会组织或者律师等专业人士的意见和帮助。