根据《女职工劳动保护特别规定》，女职工在生育期间享受国家规定的产假，并享有相应的产假待遇。在您休假期间，公司未支付您的底薪工资，而是代为承担了保险费用。然而，公司在生育津贴中未能完全支付所有应得款项，导致您实际得到的金额与法律规定不符。 关于生育津贴的计算，通常按照员工所在地区的规定执行，包括生育保险基数、生育津贴标准等。如果您的生育津贴没有全部被公司支付，那么可能是因为存在一些额外的费用或扣款。此外，生育津贴并非仅限于基本工资的一部分，还可能包含其他福利待遇。 对于您所遇到的情况，建议您直接向当地的劳动监察部门或者当地的人力资源和社会保障局进行投诉和寻求帮助。他们可以为您提供具体的指导和解决方案，确保您的权益得到维护。同时，也可以考虑通过法律途径解决这个问题，以获得更多的赔偿和补偿。请注意，具体情况需要根据具体法律法规来确定，因此建议您详细咨询相关专业人士以获取准确的法律意见。