根据您提供的信息，您父亲遭遇交通事故并获得了一定数额的保险赔偿。在此情况下，他是否可以要求单位返还其支付给他的部分费用呢？答案是肯定的。 首先，根据《社会保险法》的规定，职工因工外出期间发生事故下落不明的，其企业缴纳的基本医疗保险费由工伤保险基金按照个人账户余额一次性结付；职工因工作原因受到事故伤害或者患职业病需要暂停工作接受工伤医疗的，在停工留薪期内原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。因此，即使单位未向您的父亲支付全部费用，但您可以要求单位按照法律规定退还已支付的部分费用。 其次，根据《劳动法》的规定，用人单位应当依法为劳动者参加基本养老保险，并按时足额缴纳各项社会保险费。如果您认为单位没有及时缴纳养老保险费用，您可以要求单位补缴该期间的养老保险费用。 综上所述，建议您与单位进行协商解决此事，以维护自己的合法权益。如果协商不成，可以考虑通过法律途径解决问题。