您所描述的情况涉及的是工伤赔偿的问题。根据我国《工伤保险条例》的规定，职工因工外出期间发生事故或者在抢险救灾中下落不明的，其直系亲属可以领取供养亲属抚恤金。但需要注意的是，这个规定适用于因工作原因导致的意外伤害或死亡情况。 如果您父亲是在工作中受伤，并且符合上述条件的话，他可以获得相应的工伤待遇和供养亲属抚恤金。不过，在具体操作过程中，还需要遵循当地的法律法规和相关程序。此外，如果您的父亲已经签署了医疗转诊协议，那么这通常意味着他已经同意接受重庆医院的治疗，而无需再经过公司的同意。 总之，关于您提到的协议书是否有效的问题，建议您先与相关的法律专家进行详细咨询，以便更好地了解具体情况并获得专业的法律意见。