根据《中华人民共和国劳动法》第四十四条规定，“休息休假”是劳动者享有的一项基本权利。在法定休假日和婚丧假期间以及依法参加社会活动期间，用人单位应当依法支付工资。 在您的情况下，如果按照公司的做法进行处理，即扣除12小时加班时间后再按剩余的52小时计算加班工资，这将违反法律规定。因为根据《中华人民共和国劳动法》的规定，劳动者享有正常的每周工作时间为40小时，因此任何超过这个标准的工作时间都应被视为加班，并且应该得到相应的加班费。 如果您认为自己的权益受到了侵犯，建议您与公司协商解决，或者向当地的人力资源和社会保障局投诉，寻求帮助。同时，也可以考虑通过法律途径维护自己的合法权益，比如申请劳动仲裁或提起诉讼。 请注意，以上信息仅供参考，具体操作还需依据相关法律法规及实际情况来决定。